Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cnih3Q6ZWS4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cnih3Q6ZWS4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnih3Q6ZWS4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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