Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms