Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtifQ6PEE2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms