Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PdgfrlQ6PE55 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PdgfrlQ6PE55 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PdgfrlQ6PE55 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PdgfrlQ6PE55 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PdgfrlQ6PE55 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PdgfrlQ6PE55 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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