Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms