Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trak1Q6PD31 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trak1Q6PD31 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms