Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HltfQ6PCN7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HltfQ6PCN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms