Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herc4Q6PAV2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms