Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms