Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp49Q6P9L4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp49Q6P9L4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp49Q6P9L4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp49Q6P9L4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp49Q6P9L4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Usp49Q6P9L4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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