Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms