Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms