Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4Q6P1D7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms