Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Soga3Q6NZL0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms