Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms