Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd2Q6NXI6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms