Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms