Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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