Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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