Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap20Q6IFT4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap20Q6IFT4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms