Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms