Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn1Q6A0D4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms