Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cep290Q6A078 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms