Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Pdzrn3Q69ZS0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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