Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntn4Q69Z26 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms