Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc8eQ66JT1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms