Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms