Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top2bQ64511 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms