Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms