Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CochQ62507 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CochQ62507 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CochQ62507 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CochQ62507 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CochQ62507 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms