Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vil1Q62468 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms