Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcncQ62447 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcncQ62447 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms