Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms