Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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