Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Hoxa13Q62424 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Hoxa13Q62424 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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Hoxa13Q62424 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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