Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Ttf1Q62187 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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