Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms