Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim25Q61510 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms