Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vsx2Q61412 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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