Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln3Q61124 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms