Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd6Q61003 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms