Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms