Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms