Protein–RNA interactions for Protein: Q60864

Stip1, Stress-induced-phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stip1Q60864 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stip1Q60864 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms