Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2cQ60772 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2cQ60772 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cdkn2cQ60772 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn2cQ60772 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cdkn2cQ60772 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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