Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms