Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScinQ60604 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ScinQ60604 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms