Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms