Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms