Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms